Su estadio papal estuvo marcado por guerras con la familia Sforza,Orsini y Farnesio, que fueron enemigos principales de la familia y de su ideal de consolidar el estado italiano.Los Borgias mas allá de sus escándalos amorosos y la corrupción  esta familia tenia un problema de identidad con los italianos, pues ellos era españoles y a menudo recibían visitantes de España, que insultaban al pueblo y producía enfrentamientos violentos en el Vaticano.